Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptcd3Q14C51 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms