Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Perm1Q149B8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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