Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spatc1Q148B6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spatc1Q148B6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spatc1Q148B6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spatc1Q148B6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spatc1Q148B6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spatc1Q148B6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Spatc1Q148B6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Spatc1Q148B6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Spatc1Q148B6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spatc1Q148B6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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