Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms