Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rundc1Q0VDN7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms