Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms