Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps8Q0P5W1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms