Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ubxn2bQ0KL01 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ubxn2bQ0KL01 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms