Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NeblQ0II04 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NeblQ0II04 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms