Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cnnm1Q0GA42 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnnm1Q0GA42 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm1Q0GA42 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms