Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SctQ08535 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SctQ08535 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SctQ08535 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SctQ08535 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SctQ08535 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SctQ08535 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SctQ08535 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SctQ08535 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SctQ08535 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SctQ08535 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SctQ08535 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SctQ08535 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SctQ08535 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SctQ08535 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SctQ08535 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SctQ08535 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms