Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms