Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou6f1Q07916 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms