Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms