Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms