Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal1Q05A62 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms