Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mex3cQ05A36 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms