Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r236Q05A06 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r236Q05A06 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r236Q05A06 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r236Q05A06 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r236Q05A06 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r236Q05A06 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmn1r236Q05A06 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms