Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs3Q05895 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms