Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SryQ05738 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SryQ05738 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SryQ05738 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SryQ05738 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SryQ05738 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms