Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a1Q05722 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a1Q05722 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a1Q05722 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a1Q05722 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a1Q05722 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a1Q05722 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a1Q05722 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a1Q05722 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms