Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk18Q04899 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms