Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox8Q04886 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms