Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smarcad1Q04692 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smarcad1Q04692 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms