Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff2Q03404 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms