Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfiaQ02780 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms