Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd1Q02242 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd1Q02242 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms