Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mc1rQ01727 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mc1rQ01727 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms