Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms