Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde1bQ01065 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms