Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csf2raQ00941 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf2raQ00941 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms