Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbp4Q00724 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms