Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga4Q00651 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms