Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb1Q00420 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb1Q00420 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms