Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Flt3Q00342 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Flt3Q00342 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms