Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax8Q00288 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pax8Q00288 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms