Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cds1P98191 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms