Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smn1P97801 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smn1P97801 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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