Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cry1P97784 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cry1P97784 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cry1P97784 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cry1P97784 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms