Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Taf1bP97358 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1bP97358 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms