Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmsP97355 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmsP97355 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmsP97355 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SmsP97355 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SmsP97355 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SmsP97355 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms