Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mesp1P97309 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mesp1P97309 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mesp1P97309 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mesp1P97309 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mesp1P97309 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mesp1P97309 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mesp1P97309 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mesp1P97309 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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