Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll3P85442 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms