Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx1P81068 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms