Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptprn2P80560 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptprn2P80560 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms