Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tp53bp1P70399 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tp53bp1P70399 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms