Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf11P70378 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf11P70378 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms