Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp4P70343 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp4P70343 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp4P70343 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms