Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tbx6P70327 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms