Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tgif1P70284 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms